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中南大学陈超课题组在精神障碍遗传机制领域取得系列进展

本网讯 近日,中南大学生命科学学院陈超课题组在精神障碍的遗传解析和疾病机制领域取得系列进展:在《自然通讯》(Nature Communications)、《分子精神病学》(Molecular Psychiatry)、《生物精神病学》(Biological Psychiatry)以及中国顶级生物信息学期刊《基因组、蛋白组与生物信息学》(Genomics, Proteomics & Bioinformatics)上发表4篇高水平论文。研究团队从静态遗传到动态环境、从群体风险到精准亚型,勾勒出精神障碍遗传解析的完整图景。

团队在《自然通讯》发表的《常见变异对脑内基因表达的影响--从RNA到蛋白质再到精神分裂症风险》(Impact of common variants on brain gene expression from RNA to protein to schizophrenia risk)一文中,系统解析了遗传变异在转录、翻译到蛋白质各层面的调控效应,并首次在人脑中展示了其沿“中心法则”传递过程的逐级衰减模式。研究发现疾病相关的遗传调控并不局限于转录层面,而在多组学层面呈现出不同的调控路径,为理解精神分裂症的分子机制提供了全新的视角。

团队在《分子精神病学》上发表的《精神病性障碍生物分型的遗传学分析:共享的祖先校正多基因风险与独特的基因组关联》(Genetic analysis of psychosis Biotypes: shared Ancestry-adjusted polygenic risk and unique genomic associations)一文中,研究基于B-SNIP(双相情感障碍-精神分裂症中间表型网络)项目2505例跨人群样本,建立祖先校正多基因风险评分框架,发现三大精神病性生物亚型共享的疾病遗传背景,并且保留各自独特的分子表型信号。同时,研究团队寻找与这三类精神病性障碍生物亚型有潜在因果关系的基因,揭示了生物亚型分类在发现疾病风险基因的潜力,为个体化诊疗奠定遗传学基础。

团队在《生物精神病学》发表的《应答数量性状位点揭示疾病中的基因——环境交互作用》(Response Quantitative Trait Loci Unveiling Gene-Environment Interactions in Diseases)的评述论文中,提出了“反应性数量性状位点(reQTL)”框架:在传统的表达数量性状位点(eQTL)仅检测基线表达的基础上,加入激素、药物、感染等环境刺激,捕捉基因型——环境交互下才显现的动态调控信号。通过汇总多项reQTL研究,发现部分GWAS(全基因组关联分析)信号在受激状态下才与分子表型共定位,而基线eQTL无法检出,提示相关环境刺激是揭示精神分裂症等复杂疾病隐藏遗传机制的关键“环境开关”。文章为精神病精准医学提供可复制的“环境-基因”动态评估范式。

在《基因组、蛋白组与生物信息学》在线发表的《单细胞/单核RNA测序数据中基因表达定量测量的精准性与准确性》(Precision and Accuracy in Quantitative Measurement of Gene Expression from Single-cell/nucleus RNA Sequencing Data)一文中,团队通过整合23套高质量sc/snRNA-seq数据(>360万细胞),首次系统量化单细胞基因表达的精度与准确度,并建立可落地的实验与质控标准:研究提出“500细胞/类型/个体+ RIN ≥ 7 +信噪比阈值”的硬性质控标准,并发布开源工具VICE,通过输入细胞数、效应值与噪声即可估算差异表达真阳性率,为实验设计提供实时反馈。研究呼吁期刊与基金将CV/SNR质控纳入审稿与数据提交要求,以遏制在单细胞领域因样本量不足等导致的假阳性结果过高的现象。

以上工作均得到国家重点研发计划、基金委优秀青年基金和面上基金项目的支持。

(一审:赵云逸 二审:邓皓迪 三审:韩艳)